边牧的毛色有好几种，有灰色、黑色、咖啡色、浅黄色和白色（比较少见），其中黑色和咖啡色是母犬繁殖出来的颜色（配种基因型为bb或cc），其他颜色均为公犬（Bb或者Cc）与母犬繁殖产生后代所形成的毛色。 所以如果这只边牧是公犬（根据毛发判断公母很简单，一般公犬尾巴上的毛又浓又长且蓬松，而母犬则短而且薄）且黑色和咖啡色的毛发比例接近1：1的话，那么就是纯的三色边牧；如果是雌性且毛色均匀，则是四色边牧。 上图这个例子就能很好的解释这个问题，图中两只边牧一黑一灰，明显能看出二者的性别，同时也能看到黑色和灰色的毛发在二者身上都是呈均匀分布状态，所以毛色上来说是纯的。 但如果像下图这样，一只边牧全身主要覆盖着黑色和红色的毛发，而且红色部分看起来比较鲜艳，这就是不纯的情况了，因为红色是由特定基因控制的（具体基因型我忘记了....）。 这种情况下，可能这只边牧带有博美或者德牧的血统。
杨储光优质答主边牧的毛发有黑色，巧克力色，蓝色色，还有斑点色，三色色等等。而三色红陨石边牧并不是纯种边牧。红陨石犬，一般指拥有棕色被毛的德国牧羊犬，但在一些犬种中也可出现这种毛色，如边境牧羊犬，杜宾犬等。
出现这种毛色的原因，据信是由于基因突变。在德国牧羊犬FCI标准中，这种毛色并不被认可。在美国AKC的犬种标准中是认可的。在边牧FCI标准中，这种毛色也不被认作是纯种犬，而美国AKC标准则认可斑点色，包括红陨石色（pied）。
在AKC标准中，斑点毛色有三类：红色斑点色（red-pied）、黑色斑点色(black-pied)和纯白(within white)。这三种类型均是被认可的。其中黑色斑点色，其斑点必须是纯黑色，无任何杂色，而红色斑点，可以有轻微的杂色（black tipping）。同时标准中也注明了斑点色的区域不应与其他杂色犬混淆，如merle斑的犬。因此，在AKC中，所谓的“陨石犬”是完全被认可的。
